SARS-CoV-2 S蛋白还含有2段分别与两种肉毒杆菌神经毒素(Botulinum neurotoxin type D or G precursors)高度相似的基序,其中S蛋白中位于T299 至Y351之间,与G型肉毒杆菌神经毒素前体(Botulinum neurotoxin type G precursors)高度相似的基序同样具有预测的TCR结合高亲和力和强烈的T细胞反应触发能力。这2段肉毒杆菌神经毒素样基序继承自SARS-CoV-1,后者S蛋白含有3段与肉毒杆菌神经毒素高度相似的基序。
SARS-CoV-2 S蛋白S1/S2位点附近含有一个与眼镜蛇属和银环蛇属的神经毒素同源的蛇神经毒素样区域(snake-toxin like region),蛇神经毒素通过该区域与一种神经元受体--烟碱型乙酰胆碱受体(nAChR)相互作用、结合。HIV的gp120蛋白、狂犬病病毒(Rabies Virus,RABV)的糖蛋白G(狂犬病病毒的Spike)也具有相似的蛇神经毒素样区域。SARS-CoV-2的大脑、神经毒性可能同时与S蛋白的furin切割序列RRAR'SVAS、蛇神经毒素样区域及其它结构有关。SARS-CoV-2 S蛋白的蛇神经毒素样区域(Y674~R685)与上面刚刚谈到的SEB样区域高度重合。
SARS-CoV-2含有借鉴自医疗药剂的基因、多肽结构。
SARS-CoV-2 S蛋白结合人类GRP78(Glucose Regulating Protein 78,葡萄糖调节蛋白78)受体的四个多肽区域(四段基序),与肿瘤化疗的药物载体Pep42在序列、空间环状性质、物理、化学性质上都具有相似性。环状小分子多肽(寡肽)pep42是2006年从人类黑色素瘤癌细胞中筛选、鉴定出来的,它是GRP78的特异性结合配体,具有独特的GRP78结合能力。GRP78广泛存在于各种细胞的细胞膜上和细胞质中,被称为细胞伴侣蛋白,通过结合GRP78,pep42可被后者搭载、输送到各种癌细胞中,是极佳的化疗药物载体。
论文原文:
Indeed, SARS-CoV-2 spike protein mixed with human whole blood caused RBC aggregation [40], while spike protein from two other coronavirus strains also induced HA [41,42].
SARS-CoV-2 Spike Protein Induces Hemagglutination: Implications for COVID-19 Morbidities and Therapeutics and for Vaccine Adverse Effects
SARS-CoV-2 刺突蛋白诱导血凝:对COVID-19 发病、治疗以及疫苗不良反应的影响 https://www.mdpi.com/1422-0067/23/24/15480
SARS-CoV-2的ORF3a蛋白含有金黄色葡萄球菌来源的,可结合、吸收血红素的NEAT(near iron transporter)结构域,以及相同来源的,负责血红蛋白定位(锚定,即绑定、结合),血红素结合/捕获、吸收的IsdA、IsdC 和IsdH等Isd蛋白(Iron-Regulated Surface Determinant protein铁调节表面决定蛋白)序列。SARS-CoV-2 ORF3a蛋白的NEAT结构域由紧密堆积的IsdA、IsdC、IsdH 域组成。
SARS-CoV-2能以ORF3a 蛋白靶向攻击/结合血红蛋白的1-β 链促使血红蛋白释放血红素,ORF3a还能够将血红素降解为卟啉和铁,并摄取从血红素中解离、释放的亚铁离子。ORF3a蛋白能够通过细菌来源的HemS结构域将血红素直接分离为铁和卟啉;也能够通过HemS结构域或另一种细菌来源的ABM结构域先裂解血红素的四吡咯环结构(cleaving the heme tetrapyrrole ring structure),而后在NADPH-细胞色素P450还原酶存在的情况下降解血红素并释放铁。
COVID-19 :Attacks the 1-Beta Chain of Hemoglobin to Disrupt Respiratory Function and Escape Immunity by Capsid-Like System
COVID-19:攻击血红蛋白的1-β链,通过衣壳样系统破坏呼吸功能并逃避免疫